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生物反应器是将原始反应物与固定化酶和其他反应元素在反应容器中进行反应的系统，其中控制和管理温度、辫贬、压力等。经过合成、分解、转化和除去，得到所需的产物物质。

1. 反应元素

所采用的反应要素主要有纯化的酶、细胞和微生物。酶是生物体内的催化剂，是经典常用的反应元素。

广义上讲，也利用植物细胞、肝细胞、血细胞等动物细胞、线粒体、质体等细胞内细胞器、激素受体、抗体等中发生的反应。

2. 反应元件的固定

固定反应元件的主流方法是载体结合法，将反应元件结合到不溶性载体上。其他方法包括交联法（将反应元素交联在一起）和封装法（使用封装剂）。

通过固定反应元件，可以更容易地将反应元件与产物分离。还有一种方法，其中反应元件不被固定而是保持浮动。